El Programa Comenius tiene por objeto reforzar la dimensión europea en el campo de la educación infantil, primaria y secundaria, promoviendo la movilidad y la cooperación entre centros educativos.
Subvenciona las siguientes acciones descentralizadas gestionadas por la Agencia Nacional:
 
•    Asociaciones escolares
•    Ayudas para la formación continua del profesorado
•    Ayudantías para futuros profesores y profesoras
•    Centros de acogida de Ayudantes Comenius
•    Visitas preparatorias
•    Seminarios de contacto
•    Asociaciones Comenius-Regio
•    eTwinning